以下是崔健的正式录音室专辑及歌曲列表，按发行时间顺序排列：
1. 《新长征路上的摇滚》（1989年）
- 中国摇滚史上里程碑式专辑
- 新长征路上的摇滚
- 不再掩饰
- 让我睡个好觉
- 花房姑娘
- 假行僧
- 从头再来
- 出走
- 一无所有
- 不是我不明白
2. 《解决》（1991年）
- 风格转向更硬核的摇滚
- 解决
- 这儿的空间
- 一块红布
- 寂寞像一团烈火
- 投机分子
- 快让我在这雪地上撒点野
- 像一把刀子
- 南泥湾（改编自经典红歌）
- 从头再来（与首张专辑同名但为不同版本）
3. 《红旗下的蛋》（1994年）
- 融合爵士与放克元素
- 飞了
- 宽容
- 红旗下的蛋
- 北京故事
- 盒子
- 最后的抱怨
- 误会
- 彼岸
4. 《无能的力量》（1998年）
- 尝试电子与说唱风格
- 混子
- 无能的力量
- 九十年代
- 笼中鸟儿
- 缓冲
- 另一个空间
- 春节
- 时代的晚上
5. 《给你一点颜色》（2005年）
- 分三部分探讨社会与人性
- 红色（批判现实）
- 城市船夫
- 蓝色骨头
- 迷失的季节
- 蓝色（抒情反思）
- 小城故事V21（上、中、下）
- 农村包围城市
- 黄色（戏谑反讽）
- 网络处男
- 舞过三八线
6. 《光冻》（2015年）
- 时隔十年的回归之作
- 光冻
- 死不回头
- 鱼鸟之恋（与谭维维合唱）
- 外面的妞
- 酷瓜树
- 金色早晨
- 浑水湖漫步
7. 《飞狗》（2021年）
- 数字化时代的反思与实验
- 飞狗
- 时间的B面
- 留守者
- 末日海滩
- 爱情量子定律
- 兔子牛
其他重要作品
- 现场专辑：如《新长征路上的摇滚·现场》（1992）、《摇滚交响音乐会》（2010）等。
- EP与单曲：如《一无所有》（1986年单曲）、《超越那一天》（2010年）等。
备注：崔健的音乐风格贯穿社会批判与人文关怀，每张专辑均反映特定时代语境。部分歌曲因审查问题在早期版本中有所调整，后期再版可能略有差异。
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